Computational Biology (ILS-W1)15 ECTS
(englische Bezeichnung: Computational Biology)

Lehrveranstaltungen:

• • Übung Computational Biology
    (Übung, Rainer Böckmann, Do, 15:00 - 17:00, 00.581)
  • Computational Biology (ILS 5. Semester)
    (Vorlesung, Rainer Böckmann, Di, 8:00 - 10:00, SR Biologie)
  • Literaturseminar Computational Biology
    (Seminar, 1 SWS, Rainer Böckmann, Do, 14:00 - 15:00, Raum n.V.; Raum Nr. 03.663-1 im Biologikum)

Inhalt:

Einführung in moderne Programmier-Sprachen und Simulations-Umgebungen:

• Programmierung in MATLAB (einschliesslich der Einbindung einfacher C++ Programme)

• Einführung in Diskretisierungs- und Lösungsverfahren für partielle Differentialgleichungen zur Beschreibung dynamischer Systeme

• Datenbankformate und Skript-Sprachen (PYTHON, PERL) in der Bioinformatik.

Simulation dynamischer Systeme am Beispiel aktueller biologischer Fragestellungen, z.B:

• Metabolische Flüsse

• Signaltransduktion und Transkriptions-regulatorische Netzwerke

• Zeitlich periodische Systeme

• Biologische Musterbildung

• Moleküldynamik

• Zellbewegung und morphogenetische Bewegungen

• Populationsgenetik und Evolutionsmodelle.
  

Lernziele und Kompetenzen:

Die Studierenden

• verfügen über vertiefte Kenntnisse wichtiger Programmier- und Simulationsumgebungen

• sind fähig aktuelle Simulationsmodelle in Computational Biology am Computer selbständig anzuwenden

• sind mit aktuellen Publikationen aus dem Bereich Computational Biology vertraut

• können die Inhalte aktueller Publikationen aus dem Lerngebiet diskutieren und hinterfragen

• verfügen über Kommunikationskompetenz.
  

Literatur:

Informationsmaterialien zur Vor- und Nachbereitung des Stoffes werden im Internet und als Kopien zur Verfügung gestellt.

Studien-/Prüfungsleistungen:

Klausur Computational Biology (Teil 1) (Prüfungsnummer: 32702)

Prüfungsleistung, Klausur, Dauer (in Minuten): 45, benotet

Anteil an der Berechnung der Modulnote: 50.0 %

Erstablegung: WS 2017/2018, 1. Wdh.: SS 2018

1. Prüfer:

Rainer Böckmann

Termin: 19.02.2018, 13:00 Uhr, Ort: 00.581 (Seminarraum Zellbiologie)
Termin: 13.09.2019, 14:00 Uhr

Klausur Computational Biology II (Prüfungsnummer: 32703)

Prüfungsleistung, Klausur, Dauer (in Minuten): 90, benotet

Anteil an der Berechnung der Modulnote: 50.0 %

Erstablegung: WS 2017/2018, 1. Wdh.: SS 2018

1. Prüfer:

Lars Schewe