Molecular Modeling (MolMod)5 ECTS
(englische Bezeichnung: Molecular Modeling)
(Prüfungsordnungsmodul: Molecular Modeling)

Lehrveranstaltungen:

• • Molecular Modelling (WS 2022/2023)
    (Vorlesung, 2 SWS, Dirk Zahn et al., Mo, 8:00 - 9:30, CCC 2.206)
  • Molecular Modeling PRA (SS 2023)
    (Vorlesung mit Übung, 2 SWS, Nico van Eikema Hommes et al., Mo, 12:00 - 17:00, CCC 2.202a, CCC 2.203; Mi, 13:00 - 17:00, CCC 2.202a, CCC 2.203; Fr, 8:00 - 12:00, CCC 2.202a, CCC 2.203; Anmeldung über StudON; für die genaue Zeiten, siehe Stundenplan)

Inhalt:

MM:
Kraftfelder, Molekülmechanik, Molekulardynamik, Einführung in die Modellierung komplexer Systeme. Molekulare Modellierung von Proteinen, Solvatation, Faltung und Protein-Wirkstoff Wechselwirkungen. Konzepte von Hybrid- und Coarse-graining Methoden zur Überwindung von Zeit- und Längenskalen.
Praktikum:
Einführung in Modelling-Techniken und Visualisierung, Durchführung von einfachen Rechnungen und Analyse komplexer Simulationen, Strukturdefinition, -optimierung, Moleküldynamik, Einführung in die praktische Durchführung von Hartree-Fock-Rechnungen und die Anwendung von semiempirischen Methoden, Parametrisierung und Anwendung von Kraftfeldern, Energieprofile, Übergangszustände, Coarse-graining und Hybridmethoden.

Lernziele und Kompetenzen:

Die Studierenden

• sind in der Lage Molecular Modeling Programme selbstständig anzuwenden

• können auch komplexe Fragestellungen auf geeignete molekulare Modellsysteme übertragen

• sind fähig Kraftfeld, Semiempirik, Dichtefunktional- und ab initio Berechnungen selbstständig durchzuführen

• sind in der Lage, Moleküldynamische Simulationen durchzuführen, zu analysieren und Gleichgewichtsstrukturen bzw. Übergangszustände zu identifizieren.

Bemerkung:

Verwendbarkeit des Moduls: B.Sc. Molecular Science (Vertiefungsrichtung LIFE Science)

Organisatorisches:

Achtung:
Erstablegung der Klausur erfolgt im Wintersemester, die 1.Wiederholungsmöglichkeit dann im Sommersemester;
Notenverbuchung von Klausurnote und Praktikumsleistungen erfolgt erst im Sommersemester!
Anmeldung bitte auf StudOn, um weitere Informationen zu bekommen!

Verwendbarkeit des Moduls / Einpassung in den Musterstudienplan:

1. Molecular Science (Bachelor of Science): 5-6. Semester
   (Po-Vers. 2020w | NatFak | Molecular Science (Bachelor of Science) | Vertiefungsmodule | Vertiefung Molecular Life Science | Molecular Modeling)

Studien-/Prüfungsleistungen:

Molecular Modeling (Prüfungsnummer: 20711)

Prüfungsleistung, Klausur, Dauer (in Minuten): 90, benotet, 5 ECTS

Anteil an der Berechnung der Modulnote: 100.0 %

weitere Erläuterungen:
Molecular Modelling: W90 (PL)= Schriftliche Prüfung (90 Minuten) Seminar Molecular Modelling: EX (PL) Praktikum Molecular Modelling: LAB (PL) Berechnung der Modulnote: W90 (PL) 50% + EX (PL) 25% + LAB (PL) 25%

Prüfungssprache: Deutsch

Erstablegung: SS 2023, 1. Wdh.: SS 2023

1. Prüfer:

Dirk Zahn